• Długotrwałe trudności w oddychaniu i niemożność normalnego ziania i chłodzenia się, są powszechnie obserwowane u zwierząt ze skrajną brachycefalią.
• To zaburzenie oddychania nazywane jest oddechowym zespołem obturacyjnym psów krótkoczaszkowych (BOAS) i jest postępującym zaburzeniem trwającym całe życie, które może upośledzać zdolność psa do ćwiczeń, zabawy, jedzenia i snu.

Objawy BOAS:

• głośne oddychania, nawet w spoczynku, co może brzmieć jak chrapanie, parskanie lub świszczący oddech,
• trudności w oddychaniu, w tym nadmierne dyszenie, ciężki oddech (klatka piersiowa i brzuch mogą unosić się podczas oddychania),
• trudności podczas wysiłku fizycznego (na spacerach mogą mieć niebieskie lub szare zabarwienie dziąseł - oznaka niskiego poziomu tlenu we krwi)

• U zwierząt ze skrajną brachycefalią często występują nawracające uszkodzenia powierzchni oka (rogówki), prowadzące do owrzodzenia rogówki.
• Owrzodzenia rogówki mogą wynikać z wielu przyczyn, w tym urazów i zmniejszonej produkcji łez, owrzodzenia rogówki u psów i kotów brachycefalicznych są często spowodowane różnymi zmianami anatomicznymi obserwowanymi u zwierząt brachycefalicznych w porównaniu ze zwierzętami o dłuższej kufie.

Na problemy z oczami mogą mieć wpływ:

• płytkie oczodoły (zwierzęta te mają duże i" wyłupiaste" oczy),
• nieprawidłowości powiek,
• wydatne fałdy nosowe.

Objawy świadczące o problemach z oczami:

• mrużenie oczu,
• nadmierne mruganie,
• wrażliwość na światło,
• pocieranie oczu łapami,
• zaczerwienienie,
• zmętnienie oka,
• nadmierne łzawienie.

• U zwierząt brachycefalicznych  występują częste, przewlekłe podrażnienia i infekcje skóry.
• Dotyczy to zwłaszcza psów z nadmiernymi zmarszczkami i fałdami skórnymi, zwykle występującymi na pysku (fałdzie nosowym), ale także wokół ogona i sromu u samic.
• Głębokie fałdy skórne powodują otarcia i zatrzymywanie wilgoci, co może prowadzić do nadmiernego rozwoju bakterii i drożdżaków. Organizmy te żywią się wydzielinami skóry uwięzionymi w fałdzie, tworząc doskonałą pożywkę dla infekcji.
• Miejscowe infekcje w tych fałdach są częste, jeśli nie są regularnie czyszczone.
• Zakażenia mogą być bolesne, zwłaszcza jeśli na skórze występuje owrzodzenie.

• Niektóre psy brachycefaliczne, zwłaszcza te ze zwiniętymi, bardzo krótkimi lub pozbawione ogonów, są narażone na zwiększone ryzyko wystąpienia nieprawidłowo ukształtowanych kręgów.
• Nieprawidłowo ustawione kręgi, powodują deformacje kręgosłupa, w tym skrzywienia i skręcenia (kifozy i/lub skoliozy).
• Stan ten może doprowadzić do niestabilności kręgosłupa, a rezultacie do ucisku i uszkodzenia rdzenia kręgowego lub nerwów z niego wychodzących.

Objawy choroby rdzenia kręgowego wynikające z deformacji kręgosłupa:

• ból,
• chwiejność,
• osłabienie tylnych nóg,
• nieprawidłowy sposób chodzenia,
• zanik mięśni tylnych nóg,
• nieprawidłowy kształt grzbietu.

• Trudności w porodzie (dystocja) są powszechne u ras brachycefalicznych ze względu na wielkość rodzących się szczeniąt w porównaniu z rozmiarem miednicy matki.
• Cechy fizyczne, takie jak większe głowy, powodują, że szczenięta mają głowy zbyt duże, aby przejść przez stosunkowo wąską miednicę matki bez interwencji medycznej lub chirurgicznej.
• Bez interwencji weterynaryjnej trudności z porodem mogą doprowadzić do śmierci szczeniąt, a często i matki. W rezultacie odsetek cięć cesarskich jest wysoki u tych ras, aż do 86% u buldogów.
• Niektórzy hodowcy decydują się na „planowe” cesarskie cięcie u swoich suk, aby uniknąć problemów podczas porodu.